A differenza dell'elettricità, i campi magnetici non hanno carica. Pertanto, i termini positivo e negativo non hanno lo stesso significato per i campi magnetici come per i campi elettrici. La legge di Gauss per il magnetismo afferma che non ci sono "cariche magnetiche" paragonabili alle cariche elettriche. La somma del campo magnetico totale attraverso qualsiasi superficie è zero.
Invece, il campo magnetico di un materiale è generato da un dipolo. I dipoli magnetici sono meglio rappresentati come anelli di corrente, ma assomigliano a "cariche magnetiche" positive e negative, legate inseparabilmente insieme, senza "carica magnetica" netta. In termini di linee di campo, questa equazione afferma che le linee di campo magnetico non iniziano né finiscono, ma creano anelli o si estendono all'infinito e viceversa. In altre parole, qualsiasi linea di campo magnetico che entra in un dato volume deve uscire da qualche parte da quel volume.
Dal punto di vista della fisica, quindi, i poli magnetici non hanno azioni specifiche. Uno non è più forte dell'altro. Un polo non è rilassante e un altro energizzante. Non esiste una ricerca scientifica valida e rispettabile a sostegno di un'azione separata per ciascun polo. La questione della polarità si concentra principalmente sui magneti statici. Anche se esiste una base per le differenze di polarità, il concetto rimane discutibile. I campi di ogni magnete si piegano sui lati e "invertono la polarità", il che significa che posizionare un magnete sul corpo fornirà comunque un'esposizione bipolare. Una volta che esiste una linea di campo magnetico, è sia continua che infinita in un anello, senza movimento o direzione, secondo la legge di Gauss per il magnetismo. In ogni caso, gli esseri umani sono continuamente esposti a entrambe le polarità.
La maggior parte della ricerca che utilizza campi magnetici variabili nel tempo non tiene conto della polarità. Poiché i PEMF sono sempre in movimento, si espandono e collassano attraverso i tessuti, sono essenzialmente bipolari. I PEMF possono essere progettati per essere positivi e/o negativi, sebbene non siano state scoperte differenze sistematiche in una polarità rispetto all'altra.
Un sistema PEMF può essere progettato per produrre teoricamente solo un campo "positivo" o "negativo". In questo caso la polarità si riferisce alla posizione rispetto alla linea elettrica 0 su un oscilloscopio. Non è stata trovata alcuna differenza sistematica scientificamente validata negli effetti della "polarità" rispetto a un'altra.
In effetti, spesso quando si parla di PEMF, la "polarità" può effettivamente riferirsi alla polarizzazione. Ciò significa semplicemente l'orientamento del campo magnetico, tipicamente e semplicemente, indipendentemente dal fatto che sia orizzontale o verticale nel suo orientamento.